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過氧化氫酶存在于所有已知的動(dòng)物的各個(gè)組織中，特別在肝臟中以高濃度存在。在投彈手甲蟲（bombardier beetle）中，過氧化氫酶具有獨(dú)特用途。這種甲蟲具有兩套分開儲(chǔ)存于腺體中的化學(xué)物。大的腺體中儲(chǔ)存著對(duì)苯二酚和過氧化氫，而小的腺體中儲(chǔ)存著過氧化氫酶和辣根過氧化物酶。當(dāng)甲蟲將兩個(gè)腺體中的化學(xué)物質(zhì)混合在一起時(shí)，就會(huì)釋放出氧氣，而氧氣既可以氧化對(duì)苯二酚又可以作為助推劑。
過氧化氫酶也普遍存在于植物中，但不包括真菌，雖然有些真菌被發(fā)現(xiàn)在低pH值和溫暖的環(huán)境下能夠產(chǎn)生該酶。
絕大多數(shù)需氧微生物都含有過氧化氫酶。例外包括Streptococcus，一種沒有過氧化氫酶的需氧細(xì)菌。部分厭氧微生物，如Methanosarcina barkeri，也含有過氧化氫酶。
過氧化氫酶在食品工業(yè)中被用于除去用于制造奶酪的牛奶中的過氧化氫。過氧化氫酶也被用于食品包裝，防止食物被氧化。在紡織工業(yè)中，過氧化氫酶被用于除去紡織物上的過氧化氫，以保證成品是不含過氧化物的。它還被用在隱形眼鏡的清潔上：眼鏡在含有過氧化氫的清潔劑中浸泡后，使用前再用過氧化氫酶除去殘留的過氧化氫。過氧化氫酶在美容業(yè)中的使用：一些面部護(hù)理中加入了該酶和過氧化氫，目的是增加表皮上層的細(xì)胞氧量。
過氧化氫酶在實(shí)驗(yàn)室中還常常被用作了解酶對(duì)反應(yīng)速率影響的工具。
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