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淀粉酶。淀粉酶主要有α-淀粉酶和糖化酶。α-淀粉酶能將淀粉大分子分解為易被吸收的中、低分子物質。糖化酶能將α-淀粉酶分解的中、低分子物質進一步水分解為葡萄糖，被動物吸收利用。
蛋白酶。蛋白酶是降解蛋白質肽鏈的水解酶，主要有胃蛋白酶、胰蛋白酶、木瓜酶等。
纖維素酶。纖維素酶能破壞纖維素的結晶結構，將纖維素大分子水解為低聚糖片斷，和將低聚糖物質分解為葡萄糖。
β-葡聚糖酶。β-葡聚糖廣泛存在于多種植物原料中，粘性較大，是影響營養分子傳遞和吸收的一個重要的抗氧因子。β-葡聚糖酶能水解葡聚糖等大分子，降低消化道中物質的粘度，促進營養物質的吸收。β-葡聚糖酶是酶制劑飼料添加劑中較為重要和應用較廣泛的一種酶。
果膠酶。果膠質是植物性原料中一種抗營養因子，影響飼料的利用率。果膠酶能有效破壞果膠質，促進營養成分的消化和吸收。果膠酶也是較常用的一種飼料酶制劑。
植酸酶。谷物中的磷絕大多數是以植酸磷的形式存在，動物本身不分泌植酸酶，所以對谷物中這部分磷的利用率較低，而通過在飼料中添加微生物分泌的植酸酶，就可以將這部分磷分解釋放出來，從而減少無機磷在飼料中的添加量，降低飼料成本，并且可以減少動物糞便中磷的排泄量降低環境污染。是目前應用較多且前景最好的一種綠色飼料添加劑。
復合酶。復合酶是將兩種或兩種以上具有生物活性的酶混合而成的產品。復合酶根據不同動物和不同生長階段的特點進行配制，有較好的作用，是目前最常用的飼料添加劑。
直接分解營養物質，提高飼料利用率。具有活性的多種酶能有效地將飼料中一些分子多聚體分解和消化成動物容易吸收的營養物質，或分解成為小片段營養物質，供其他消化酶進一步消化。一些大分子物質，動物本身難于分解和吸收，因而添加酶制劑，可促進飼料中營養的分解和消化，從而提高飼料利用率。
消除抗營養分子，改善消化機能。植物性原料存在一些非淀粉多糖、果膠、植酸、纖維素聚合物，這些物質使動物消化道中內容物和粘度增加，影響動物對有效營養成分的消化和吸收。酶制劑中多種酶特別是β-葡聚糖酶、果膠酶、植酸酶和纖維素酶能將這些物質分解為小分子物質，從而降低了消化道中物質的粘度，有效消除這些抗營養因子的不良影響，改善動物的消化性能。
激活內源酶的分泌，提高消化酶的濃度。由于酶制劑的使用，可提供更多可供多種酶的基質，從而激活動物體內多種消化酶更多地分泌，提高消化酶的有效含量，加速營養物質的消化和吸收，從而提高飼料利用率和加速動物的新陳代謝，促進動物生酶制劑飼料添加劑的合理應用
科學選用酶制劑產品。酶制劑產品是近年來廣泛應用的一類飼料添加劑，現在多數酶制劑商品為復合酶制劑，實際應用也以選用復合酶制劑為主。衡量酶制劑的質量水平和作用效果的依據主要是酶的種類、含量、活性和穩定性。由于這些指標目前在應用上較難檢測和判斷，因此在選用時應特別注意。一些大型和專業的酶制劑生產廠家，能對酶制劑產品進行包被等特殊處理，可提高酶的活性和穩定性，因此在選用酶制劑產品時最好選用一些信譽好、被人們廣泛認可的產品，有條件最好進行一些試驗后，再大量地應用。
根據動物種類和不同生長階段應用。由于酶有高度的專一性和特異性，不同動物種類和不同的生長階段，動物體內酶的種類和數量并不相同，因此根據不同動物和不同生長階段的特點選用合適的酶制劑，才能有效地發揮和提高酶制劑的作用效果。動物的幼齡階段，消化系統的發育尚不完善，多種消化酶都分泌不足，是使用酶制劑較理想的階段。一般應選用含有多種消化酶的酶制劑，特別是蛋白酶和淀粉酶為主的酶制劑。而動物的成年階段消化機能較為完善，對多種營養物質都有較好的消化能力，因此應用時最好選用β-葡聚糖酶、植酸酶、果膠酶等對抗營養因子有消除作用的酶制劑。水產動物飼料應用富含蛋白酶和纖維素酶的酶制劑。一般情況下，家畜使用酶制劑的作用效果比家禽好，幼年階段使用比成年階段好。
結合飼料中原料情況應用酶制劑。飼料配方以玉米-豆粕型為主的，最好應用以木聚糖酶、果膠酶和β-葡聚糖酶為主的酶制劑;較多使用小麥、大麥和米糠等原料的，應選用以木聚糖酶和β-葡聚糖為主的酶制劑;飼料中稻谷粉、米糠和麥麩等含量較多時應選用β-葡聚糖酶、纖維素酶為主的酶制劑;而飼料中較多使用菜籽粕、葵花籽粕等蛋白含量較高的原料時，最好選用以纖維素酶、蛋白酶和乙型甘露聚糖酶為主的酶制劑。
酶制劑與其他添加劑的相互影響。一些試驗和研究表明，在使用酶制劑時，適當添加一些氧化鈷、硫酸錳和硫酸銅等鹽類，可提高酶制劑的作用效果。酶制劑與抗生素沒有相互影響和拮抗作用，酶制劑可以與抗生素促生長類添加劑協同使用。
注意生產工藝的影響。酶制劑的主要成分是活性酶。酶是一種蛋白質，對熱、光、酸等較敏感，而飼料的生產過程中由于粉碎、預混、制粒以及其他添加劑的影響，都可能使酶的活性損失，甚至變性。因此，使用酶制劑應盡可能地減少生產工藝對酶活性的影響，特別是制粒的溫度最好不要超過75℃，以保證酶制劑有較好的作用效果。
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